TAP Zinc finger, AN1 and A20 type in Panicum virgatum

Full lineage¹: cellular organisms; Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Streptophytina; Embryophyta; Tracheophyta; Euphyllophyta; Spermatophyta; Magnoliopsida; Mesangiospermae; Liliopsida; Petrosaviidae; commelinids; Poales; Poaceae; PACMAD clade; Panicoideae; Panicodae; Paniceae; Panicinae; Panicum; Panicum sect. Hiantes

Protein source: Phytozome (proteins from primary transcripts)


The colour code corresponds to the rules for the domains:

should be contained
should not be contained

Domain rules


(Domain names are clickable)



List of proteins (35)

hide all | show all
namename additionClick button to show/hide sequence: Download sequence?
Pavir.Aa03012.1.ppacid=30251558 transcript=Pavir.Aa03012.1 locus=Pavir.Aa03012 ID=Pavir.Aa03012.1.v1.1 annot-version=v1.1
Pavir.Ab01053.1.ppacid=30235203 transcript=Pavir.Ab01053.1 locus=Pavir.Ab01053 ID=Pavir.Ab01053.1.v1.1 annot-version=v1.1
Pavir.Ab01334.1.ppacid=30232335 transcript=Pavir.Ab01334.1 locus=Pavir.Ab01334 ID=Pavir.Ab01334.1.v1.1 annot-version=v1.1
Pavir.Ba02146.1.ppacid=30291736 transcript=Pavir.Ba02146.1 locus=Pavir.Ba02146 ID=Pavir.Ba02146.1.v1.1 annot-version=v1.1
Pavir.Ba03749.1.ppacid=30288975 transcript=Pavir.Ba03749.1 locus=Pavir.Ba03749 ID=Pavir.Ba03749.1.v1.1 annot-version=v1.1
Pavir.Bb00372.1.ppacid=30297899 transcript=Pavir.Bb00372.1 locus=Pavir.Bb00372 ID=Pavir.Bb00372.1.v1.1 annot-version=v1.1
Pavir.Bb00373.1.ppacid=30297657 transcript=Pavir.Bb00373.1 locus=Pavir.Bb00373 ID=Pavir.Bb00373.1.v1.1 annot-version=v1.1
Pavir.Bb01912.1.ppacid=30296760 transcript=Pavir.Bb01912.1 locus=Pavir.Bb01912 ID=Pavir.Bb01912.1.v1.1 annot-version=v1.1
Pavir.Bb03406.1.ppacid=30300829 transcript=Pavir.Bb03406.1 locus=Pavir.Bb03406 ID=Pavir.Bb03406.1.v1.1 annot-version=v1.1
Pavir.Da01053.1.ppacid=30192982 transcript=Pavir.Da01053.1 locus=Pavir.Da01053 ID=Pavir.Da01053.1.v1.1 annot-version=v1.1
Pavir.Ea00064.1.ppacid=30229493 transcript=Pavir.Ea00064.1 locus=Pavir.Ea00064 ID=Pavir.Ea00064.1.v1.1 annot-version=v1.1
Pavir.Ea02630.1.ppacid=30231146 transcript=Pavir.Ea02630.1 locus=Pavir.Ea02630 ID=Pavir.Ea02630.1.v1.1 annot-version=v1.1
Pavir.Ea02819.1.ppacid=30230980 transcript=Pavir.Ea02819.1 locus=Pavir.Ea02819 ID=Pavir.Ea02819.1.v1.1 annot-version=v1.1
Pavir.Eb00222.1.ppacid=30311024 transcript=Pavir.Eb00222.1 locus=Pavir.Eb00222 ID=Pavir.Eb00222.1.v1.1 annot-version=v1.1
Pavir.Eb02594.1.ppacid=30311319 transcript=Pavir.Eb02594.1 locus=Pavir.Eb02594 ID=Pavir.Eb02594.1.v1.1 annot-version=v1.1
Pavir.Eb03266.1.ppacid=30308806 transcript=Pavir.Eb03266.1 locus=Pavir.Eb03266 ID=Pavir.Eb03266.1.v1.1 annot-version=v1.1
Pavir.Eb03271.1.ppacid=30313693 transcript=Pavir.Eb03271.1 locus=Pavir.Eb03271 ID=Pavir.Eb03271.1.v1.1 annot-version=v1.1
Pavir.Eb03331.1.ppacid=30312995 transcript=Pavir.Eb03331.1 locus=Pavir.Eb03331 ID=Pavir.Eb03331.1.v1.1 annot-version=v1.1
Pavir.Fa00266.1.ppacid=30187588 transcript=Pavir.Fa00266.1 locus=Pavir.Fa00266 ID=Pavir.Fa00266.1.v1.1 annot-version=v1.1
Pavir.Fa01722.1.ppacid=30185576 transcript=Pavir.Fa01722.1 locus=Pavir.Fa01722 ID=Pavir.Fa01722.1.v1.1 annot-version=v1.1
Pavir.Gb00326.1.ppacid=30223652 transcript=Pavir.Gb00326.1 locus=Pavir.Gb00326 ID=Pavir.Gb00326.1.v1.1 annot-version=v1.1
Pavir.Gb00565.1.ppacid=30222738 transcript=Pavir.Gb00565.1 locus=Pavir.Gb00565 ID=Pavir.Gb00565.1.v1.1 annot-version=v1.1
Pavir.J02601.1.ppacid=30225222 transcript=Pavir.J02601.1 locus=Pavir.J02601 ID=Pavir.J02601.1.v1.1 annot-version=v1.1
Pavir.J03362.1.ppacid=30198559 transcript=Pavir.J03362.1 locus=Pavir.J03362 ID=Pavir.J03362.1.v1.1 annot-version=v1.1
Pavir.J04720.1.ppacid=30236723 transcript=Pavir.J04720.1 locus=Pavir.J04720 ID=Pavir.J04720.1.v1.1 annot-version=v1.1
Pavir.J06762.1.ppacid=30195998 transcript=Pavir.J06762.1 locus=Pavir.J06762 ID=Pavir.J06762.1.v1.1 annot-version=v1.1
Pavir.J06763.1.ppacid=30195999 transcript=Pavir.J06763.1 locus=Pavir.J06763 ID=Pavir.J06763.1.v1.1 annot-version=v1.1
Pavir.J07803.1.ppacid=30285925 transcript=Pavir.J07803.1 locus=Pavir.J07803 ID=Pavir.J07803.1.v1.1 annot-version=v1.1
Pavir.J10745.1.ppacid=30231736 transcript=Pavir.J10745.1 locus=Pavir.J10745 ID=Pavir.J10745.1.v1.1 annot-version=v1.1
Pavir.J14200.1.ppacid=30197932 transcript=Pavir.J14200.1 locus=Pavir.J14200 ID=Pavir.J14200.1.v1.1 annot-version=v1.1
Pavir.J17292.1.ppacid=30281823 transcript=Pavir.J17292.1 locus=Pavir.J17292 ID=Pavir.J17292.1.v1.1 annot-version=v1.1
Pavir.J17759.1.ppacid=30302137 transcript=Pavir.J17759.1 locus=Pavir.J17759 ID=Pavir.J17759.1.v1.1 annot-version=v1.1
Pavir.J21643.1.ppacid=30245115 transcript=Pavir.J21643.1 locus=Pavir.J21643 ID=Pavir.J21643.1.v1.1 annot-version=v1.1
Pavir.J23880.1.ppacid=30207319 transcript=Pavir.J23880.1 locus=Pavir.J23880 ID=Pavir.J23880.1.v1.1 annot-version=v1.1
Pavir.J26900.1.ppacid=30196495 transcript=Pavir.J26900.1 locus=Pavir.J26900 ID=Pavir.J26900.1.v1.1 annot-version=v1.1
select all | unselect

A list of species letter codes included in the protein names can be found here (opens in new tab).

↑ back to top



¹ Information recieved using NCBI E-utilities and NCBI taxonomy database.
Impressum